Институт имеет лицензию на ведение образовательной деятельности в сфере послевузовского профессионального образования (аспирантуры и докторантуры) по следующим специальностям:
01.01.02 — дифференциальные уравнения
01.01.03 — математическая физика
01.01.07 — вычислительная математика
01.01.09 — дискретная математика и математическая кибернетика
01.02.01 — теоретическая механика
01.02.05 — механика жидкости, газа и плазмы
05.13.11 — математическое и программное обеспечение вычислительных машин, комплексов и компьютерных сетей
05.13.18 — математическое моделирование, численные методы и комплексы программ
Подготовка аспирантов осуществляется по очной и заочной формам обучения. Сроки подготовки аспирантов не должны превышать трех лет по очной форме обучения и четырех — по заочной.
Подготовка докторантов осуществляется по очной форме обучения. Срок подготовки докторантов не должен превышать трех лет.
Все вопросы, связанные с поступлением, учебой, отчислением, проживанием в общежитии РАН и т.п., решает Аспирантская комиссия Института.