Головная страница ИПМ Библиотеки, издания  •  Поиск публикаций  English 
Публикация

Препринт ИПМ № 59, Москва, 2018 г.
Авторы: Тихонов Д.А., Куликова Л.И., Ефимов А.В.
Анализ площадей и периметров полигонов пересечения проекций спиралей в спиральных парах белковых молекул
Аннотация:
В данной работе проведен анализ распределения площадей и периметров полигонов пересечения проекций спиралей в парах связанных между собой перетяжками спиралей в пространственных структурах белковых молекул. Исследование проводилось на множестве спиральных пар, отобранных нами согласно разработанным правилам из структур белковых молекул, представленных в PDB. Показано, что спиральные пары всех типов, принадлежащие подмножеству пар, имеющих пересечение проекций спиралей, но не имеющих пересечения осей спиралей, имеют площади и периметры полигонов пересечения, значения которых малы или близки к нулю. Среди всех типов спиральных пар, принадлежащих подмножеству пар, имеющих пересечение проекций и осей спиралей, нет пар, имеющих малые или близкие к нулю значения площадей и периметров полигонов пересечения проекций спиралей. Максимум распределения пар, образованных двумя α-спиралями и принадлежащих данному подмножеству, отмечен при значениях площадей и периметров полигонов пересечения проекций спиралей, лежащих в области от 70 Å до 150 Å и в области от 30 Å до 45 Å, соответственно.
Ключевые слова:
структурные мотивы, точечная модель, спиральные пары в белковых молекулах, площадь и периметр полигона пересечения проекций спиралей
Язык публикации: русский, страниц: 24
Направление исследований:
Математическое моделирование в актуальных проблемах науки и техники
Полный текст: Сведения об авторах:
  • Тихонов Дмитрий Анатольевич,  orcid.org/0000-0002-1779-464X,  ИПМ им. М.В. Келдыша РАН
  • Куликова Людмила Ивановна,  orcid.org/0000-0002-7293-1504,  ИПМ им. М.В. Келдыша РАН
  • Ефимов Александр Васильевич,  orcid.org/0000-0002-9539-270X,  Институт белка РАН